La misión del Consejo de la Juventud de Cantabria se centra en:

• Defender y reivindicar los intereses y derechos de los jóvenes de Cantabria.
• Promover la participación de los jóvenes en todas las cuestiones que les afecten, facilitando su implicación en el desarrollo político, social, económico y cultural de la región.
• Fomentar el asociacionismo juvenil, estimulando la creación de asociaciones y prestando apoyo y asistencia a las existentes.
• Promover la integración y el apoyo social y cultural de las minorías juveniles marginadas, trabajando por la igualdad de oportunidades entre los jóvenes que habitan en el medio rural y urbano.
• Fomentar el desarrollo del acervo cultural y de las tradiciones cántabras, contribuyendo al desarrollo del ocio educativo y activo de la juventud.

Además, el CJC actúa como interlocutor válido con la Administración Autonómica y otros organismos públicos o privados, promoviendo la adopción de medidas en asuntos que conciernen a los jóvenes y colaborando en la elaboración de políticas juveniles que afectan a la comunidad. 

A lo largo de su trayectoria, el Consejo ha trabajado en estrecha colaboración con diversas entidades y administraciones para revitalizar su actividad y potenciar el diálogo con los jóvenes, adaptándose a los nuevos tiempos y necesidades de la juventud cántabra.